Ancak film, hayranlarını şaşırtacak şekilde, serinin merkezinde yer alan Xenomorph'lara odaklanmak yerine, daha çok Mühendisler olarak bilinen gizemli varlıkları işledi. 

Bunun nedeni, filmin ilk başta farklı bir senaryoya dayanıyor olmasıydı.

Başlangıçta "Alien: Engineers" olarak adlandırılan bu film, hem Xenomorph'ları hem de Mühendisleri içeren daha geniş bir hikâye planlıyordu. 

Orijinal senaryoda, franchise'ın klasik unsurları olan Chestburster'lar ve Facehugger'lar gibi yaratıklar da bulunuyordu.