Parasite Eve, Capcom'un Resident Evil serisinin unsurlarını Square'in karakter odaklı JRPG tarihçesiyle birleştirir.
Hideaki Sena'nın aynı adlı romanına dayanan oyun, NYPD memuru Aya Brea'nın, insan ırkını yok etmeye çalışan Mitochondria Eve'yi durdurma çabasını anlatır.
