Film, Harry, Ron ve Hermione’nin Hogwarts'taki üçüncü yıllarında ergenlik sorunlarıyla yüzleşmelerini işlerken, geçmişten gelen gizemli düşmanların geri dönüşüyle serinin seyrini değiştiriyor.

Azkaban’dan tehlikeli bir mahkum kaçar ve Harry'nin peşine düşer.

Bu durum, okulun çevresinde korkutucu Ruh Emiciler’in devriye gezmesine neden olurken, şatonun gölgelerinde sessiz bir kötülüğün kol gezdiğini hissettirir.

Eleştirmenlerce Harry Potter serisinin en iyi filmi olarak değerlendirilen Azkaban Tutsağı, Harry Potter filmlerinin belirgin bir karanlık yöne sapmasıyla dikkat çeker.